Periodo académico 2020-1S
| Actividad | Grupo | Periodos | Horarios | Aula | Profesor/Tutor |
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| SALAS ESPECIALIZADAS CÓMPUTO | (1) - SALAS ESPECIALIZADAS CÓMPUTO - GRUPO 1 - BOGOTÁ | 20/01/2020 - 21/03/2020 | MARTES 20:00 - 22:00 | AULA WINDOWS - 305 - M2 | NELSON ENRIQUE VEGA VELA |
| JUEVES 20:00 - 22:00 | AULA WINDOWS - 305 - M2 | NELSON ENRIQUE VEGA VELA | |||
| 13/04/2020 - 30/05/2020 | MARTES 20:00 - 22:00 | - | NELSON ENRIQUE VEGA VELA | ||
| JUEVES 20:00 - 22:00 | - | NELSON ENRIQUE VEGA VELA |
La biodiversidad, a nivel global, regional y nacionalmente, está sujeta a un proceso de aprovechamiento insostenible, de ahí, que 48.000 especies se encuentran en diversos grados de amenaza, por lo que se hace necesaria una nueva actitud hacia su conservación, e implementación de nuevas estrategias de utilización. Esto último, implica y genera la necesidad de colectar, mantener, analizar y entender la cantidad de datos que existen, o que se colectarán, en el contexto de la diversidad biológica y sus diferentes niveles de organización. La Bioinformática y la Biocomputación ayudarán a biólogos, investigadores, y estudiantes a desarrollar un acercamiento estructurado a los datos biológicos utilizando herramientas computacionales, además el desarrollo de algoritmos eficientes permitirá simular problemas relativos a la biología
Reconocer las aplicaciones y potencialidades que puede llegar a tener la Biocomputación en los procesos de modelado y simulación de sistemas
CONCEPTOS BÁSICOS DE BIOLOGÍA MOLECULAR E INFORMÁTICA1.1. Vida, proteínas, ácidos nucleídos1.2. Biología molecular1.3. Fisicoquímica de macromoléculas1.4. Cadenas, grafos y algoritmos1.5. Bases de datosTiempo programado:2 semanas2. COMPUTACIÓN BIOLÓGICA2.1. Sistemas biológicos2.2. Modelado biológico2.3. Ramas de la Bioinformática y la BiocomputaciónTiempo programado: 2 semanas3. BASES DE DATOS BIOLÓGICAS3.1. NCBI3.2. Swisprot3.3. Protein Data Bank3.4. Drug Data BankTiempo programado: 4 semanas4. ALINEACIÓN DE SECUENCIAS4.1. Que es alineación de secuencias.4.2. Similaridad, identidad y homología.4.3. Tipos de alineamiento.4.4. Herramientas y algoritmos para alineación de secuencias.4.5. PrimersTiempo programado: 4 semanas5. BIOCOMPUTACIÓN. 5.1. Predicción y visualización de estructuras proteicas5.2. Estructuras de ácidos nucleídos5.3. Ensamble de DNA5.4. Árboles filogenéticos5.5. Phyton y PerlTiempo programado: 4 semanas
Evaluación continua y personalizada de los logros alcanzados por cada uno de los estudiantes, efectuar pruebas y evaluaciones que permitan identificar áreas o temas de mayor dificultad para orientar la acción pedagógica, hacer retroalimentación, y resolver problemas de apropiación y comprensión de conceptos. Ver la evaluación formativa como un proceso para realizar reflexiones pedagógicas
Setubal Joao y Meidanis Joao. Introduction to computacional molecular biology. PWS Publishing Company. 1979.
Attwood Teresa K. y Parry-Smith David J. Introducciónn a la Bioinformática. Prentice Hall 2002
Bioinformatics, a practical guide to the analysis of Genes and Proteins. Baxevanis A, Ouellette F. 2001. Second Edition.
Wiley Interscience.Developing Bioinformatics Computer Skills. Gibas C, Jambeck P. 2001. First Edition.
O¿Reilly & Associates Inc.Biological Sequence analysis, probabilistic models of proteins and nucleic acids.
Durbin R, Eddy S, Krogh A. Mitchison G. 2002. Cambridge University Press.